freee会計対応の経理代行おすすめ7選｜料金相場と失敗しない選び方を徹底比較

「freee会計を導入したものの、記帳や仕訳入力が追いつかない。」

そんなお悩みはありませんか？

freeeは経理業務を大幅に効率化できる優秀なツールですが、日々の取引入力・請求書処理・給与計算まで対応するには、ある程度の人的リソースが必要です。「freeeを入れただけ」で止まってしまっている企業も少なくありません。

そんなときの解決策が、freeeに精通した経理代行業者へのアウトソーシングです。プロに任せることで入力ミスを防ぎ、リアルタイムで正確な会計データを維持しながら、経営者・担当者は本業に集中できる環境が整います。

本記事では、freee会計に対応したおすすめの経理代行・記帳代行サービスを7社厳選してご紹介します。料金相場・業者の種類・選び方のポイントから、個人事業主と法人それぞれの使い方まで徹底解説しますので、ぜひ業者選びの参考にしてください。

freee会計を使った経理代行とは

freee会計を使った経理代行とは、freeeの自動連携機能や管理画面を活用しながら、日々の記帳・経理業務を外部の専門業者に委託するサービスです。

単に入力作業を代わりにやってもらうだけでなく、freeeの機能を熟知したスタッフが正確・迅速に処理を行うため、データの精度が上がり、経営判断に使えるリアルタイムの会計情報を常に手元に置けるようになります。

経理代行と記帳代行の違い

「経理代行」と「記帳代行」はよく混同されますが、対応できる業務の幅が異なります。記帳代行は、日々の取引を会計帳簿に記録する作業（仕訳入力）に特化したサービスです。

一方、経理代行はそれに加えて、請求書の発行・管理、給与計算、各種支払い、月次レポート作成、税務対応まで、経理業務全般をカバーします。

freeeを活用した経理代行では、銀行口座やクレジットカードとの自動連携機能を活かして、データ入力の手間を大幅に削減できるのが特徴です。まずは「何を外注したいのか」を整理した上で、自社にあうサービスを選びましょう。

freeeを使った経理代行に依頼できる主な業務

freee会計対応の経理代行業者に依頼できる業務は、主に以下のとおりです。業者によって対応範囲が異なるため、事前に確認することが重要です。

紙の領収書・請求書は、自社でスキャンまたはスマートフォンで撮影してデータを送付する形が一般的です。freeeのスキャン機能を使えば自動読み取りも可能で、業者との連携がよりスムーズになります。

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代行業者の種類：2つのパターン

freee会計に対応した経理代行業者は、大きく「税理士・会計事務所型」と「オンライン秘書型」の2種類があります。自社に必要な業務範囲と予算にあわせて、適切なタイプを選びましょう。

税理士・会計事務所型

税理士や公認会計士が在籍する事務所が、freeeを活用して記帳・経理業務を代行するタイプです。

専門家による確認が入るため信頼性が高く、月次の記帳から決算・税務申告まで一気通貫でお任せできます。仕訳の正確性や税法への対応が重視される場面で特に力を発揮します。

顧問契約を結ぶ形が多く、税務相談や節税アドバイスも受けられる点も魅力です。税務知識が必要な業務が多い企業、または決算申告まで任せたい企業に向いています。

オンライン秘書型

経理・総務・秘書など複数のバックオフィス業務を、専任担当者がオンラインで代行するサービスです。

経理以外の業務もワンストップでお任せできるため、スタッフが少ないスタートアップや中小企業に向いています。月額固定制で予算管理がしやすい点が特徴です。

税理士の士業独占業務である「税務代理」「税務書類の作成」「税務相談」は資格を持たないオンライン秘書では対応できません。確定申告・決算は別途税理士と契約しつつ、日常の経理業務を外注したい企業に特に適しています。

freee会計対応の経理代行 料金相場

記帳代行（仕訳入力のみ）の場合記帳代行の料金は、月間の仕訳数・取引量によって変わります。小規模事業者なら月額数千円から始められるサービスもあり、コストを抑えながらプロに任せられます。

経理業務全般（フルアウトソース）の場合

請求書処理・給与計算・レポート作成まで含む場合は、月額3万円〜10万円程度が相場です。オンライン秘書型は実働時間で料金が決まることが多く、月20時間プランで6〜8万円前後が目安です。

社員を雇う場合との比較

経理担当者を正社員で採用した場合、給与（月25〜35万円）に加えて、社会保険料・交通費・採用コスト・研修費などを合計すると月40〜50万円以上のコストがかかります。

業務量が少ない段階では、経理代行サービスの方が圧倒的にコスト効率が高いといえます。また、担当者の急な退職や休職によるリスクがなく、freeeに精通したプロが常に対応してくれる安心感も大きなメリットです。

【タイプ別早見表つき】経理代行サービスの選び方＆おすすめ5社を徹底比較

失敗しない業者選びのポイント3つ

freee会計に対応した経理代行業者は増えており、一見どこも同じに見えることがあります。しかし、対応できる業務の範囲・料金体系・担当者のfreeeスキルレベルは業者ごとに大きく異なります。

契約後に「思っていた内容と違った」とならないよう、以下の3つのポイントを必ず確認してから選びましょう。

 freeeへの精通度・実績で選ぶ

会社のお金に関わる重要な業務であるため、freeeを使った経理代行の実績が豊富な業者を選ぶことが最重要です。freeeの「ゴールドパートナー」や「5つ星認定アドバイザー」などの認定を受けているかどうかが、信頼性を判断する際の目安になります。

業者のウェブサイトで導入実績・顧客の声・事例を確認し、自社と規模や業種が近い事例があるかどうかも確かめましょう。

 料金体系の透明性で選ぶ

料金は売上規模・月間仕訳数・対応業務の範囲によって変わります。見積もりを依頼した際に「何がいくらになるのか」を明確に示してくれる業者を選びましょう。初期費用・月額費用・オプション費用が内訳がしっかりと分かれているかを確認してください。

月額固定型は予算管理がしやすく、時間単価型は必要な分だけ依頼できる柔軟性があります。自社の業務量が安定しているか変動が大きいかによって、向いている料金形態が変わります。

 コミュニケーションのしやすさで選ぶ

経理業務は継続的な関係が前提となるため、日常的に連絡しやすい体制かどうかも重要な選定基準です。

チャット・メール・電話など複数の連絡手段を用意しているか、レスポンスの速さはどうかを無料相談の段階で確認しましょう。

無料トライアルや初月お試し期間を設けている業者なら、実際の業務感を体験してから本契約を判断できるため安心です。

個人事業主・フリーランスと法人 それぞれの選び方

freee会計を使った経理代行は、個人事業主・フリーランスと法人とでは、必要な業務範囲も費用感もまったく異なります。「規模が小さいから何でもいい」ではなく、自分の事業形態に合ったサービスを選ぶことが、コストを抑えながら最大の効果を得るポイントです。

個人事業主・フリーランスの場合

個人事業主・フリーランスの方が最も重視すべきは「確定申告まで対応してもらえるか」です。

日々の記帳と確定申告書の作成・提出をまとめてお任せしたい場合は、税理士事務所型のサービスを選ぶことで一気通貫で対応してもらえます。

一方、「記帳だけ外注して確定申告は自分でやる」という場合は、KANBEIや恵比寿 高田馬場 経理・記帳代行サービスのような低価格の記帳代行サービスが向いています。

月額数千円〜1万円程度から始められるため、コスト負担を最小限に抑えながらプロのサポートを受けられます。

法人の場合

法人の場合は業務範囲が広く、記帳に加えて給与計算・社会保険手続き・法人税申告なども必要になります。

税理士事務所型であれば、顧問契約でこれらを包括的に依頼できます。特に決算期や税務調査への対応が必要な場面では、税理士との連携が不可欠です。

経理以外のバックオフィス業務も人手不足の場合は、複数業務をワンストップで依頼できるオンライン秘書型も有力な選択肢です。

フジ子さんやi-STAFFのように、経理＋総務・秘書業務をまとめて任せられるサービスを活用することで、少人数でもバックオフィス全体を安定稼働させられます。

freee会計代行を利用するまでの流れ

freeeを使った経理代行を初めて利用する場合、どのように進めればいいか不安な方も多いでしょう。一般的な流れは以下の5ステップです。

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freee会計対応 経理代行サービス7選を比較

以下に、本記事でご紹介する7社を一覧でまとめました。種別・料金・特徴を確認して、自社の状況に合った候補を絞り込んでください。

※料金は2026年4月時点のものです。最新の料金は公式サイトをご確認ください。

続けて各社について詳しくご紹介します。

おすすめのfreee会計代行会社①：会計・経理代行

freeeを使った記帳代行・経理代行を専門とする会社・事務所を4社ご紹介します。税務申告まで含めてお任せしたい企業や、記帳コストを徹底的に抑えたい企業に特に向いています。

税理士法人クラウドパートナーズ

出典:税理士法人クラウドパートナーズ

税理士法人クラウドパートナーズは、記帳や経理業務の代行にとどまらず、クラウドツールを活用して業務フローそのものをデジタル化することに力を入れている事務所です。

経理担当者の採用・育成コストや、退職による「引き継ぎができない」といった属人化リスクを根本から解消し、経営者が本業に専念できる体制を整えることを目指しています。

グループ内に税理士法人と社労士法人が併設されている点が大きな強みで、日々の記帳データがそのまま決算・税務申告や給与計算・労務手続きへとシームレスにつながります。

対応業務は、領収書・請求書の入力から毎月の支払い処理、freeeの初期設定・ツール導入支援まで多岐にわたります。

料金は月額15,000円〜（小規模・月50仕訳まで）、月額30,000円〜（中〜大規模・仕訳数無制限）で、公式サイトのAI見積もり機能を使えばその場で金額の目安を確認できます。

【税理士法人クラウドパートナーズのサービス詳細はこちらから】

KANBEI（カンベイ）

出典:KANBEI

「KANBEI（カンベイ）」は、freee会計・マネーフォワードクラウドに特化した経理代行サービスです。業界最安水準の月額1,100円〜を実現しており、導入実績は1,200社を突破しています。

月1回、領収書や請求書のデータを送るだけでOKというシンプルな運用フローが好評で、経理知識のない経営者でも無理なく利用できます。

記帳代行に加えて、給与計算代行・請求業務代行など幅広い業務に対応しており、必要に応じてスモールスタートから始められます。

さらに会計データをもとに経費カテゴリ別のコスト診断を行い、削減できる経費を可視化してくれる独自のコンサルティング機能も魅力です。

【KANBEIのサービス詳細はこちらから】

恵比寿 高田馬場 経理・記帳代行サービス

出典:恵比寿 高田馬場 経理・記帳代行サービス

「恵比寿 高田馬場 経理・記帳代行サービス」は、記帳代行1,470円〜という価格が魅力の業者です。コストを抑えながら品質も担保したい企業にとって理想的で、提携税理士によるチェック体制が整っているため、アウトソーシングによる品質低下の心配がありません。

最短5営業日での納品に対応しており、急に試算表が必要になった際など、タイトなスケジュールでも頼りになります。

freeeの自動連携機能を最大限に活かしており、銀行明細やクレジットカードのデータを自動取込みして効率よく処理してくれます。

【恵比寿 高田馬場 経理・記帳代行サービスの詳細はこちらから】

リライル会計事務所

出典:リライル会計事務所

「リライル会計事務所」はfreeeを用いた代行を400社以上手掛けており、全国トップクラスの実績を誇ります。freee運営から5つ星アドバイザーに認定されており、freeeの活用度・サポート品質において業界最高水準の評価を受けています。

単なる記帳代行にとどまらず、経理業務フロー全体の見直しや最適化を提案してくれるのが大きな強みです。

「記帳してもらうだけでなく、自社の経理体制を根本から改善したい」という企業に特に向いています。ベンチャー・スタートアップの支援実績が豊富で、急成長期特有の経理課題（資金調達対応・投資家向けレポートなど）にも対応しています。

【リライル会計事務所のサービス詳細はこちらから】 

おすすめのfreee会計代行会社②：オンライン秘書

オンライン秘書とは、経理・総務・秘書など複数のバックオフィス業務をオンラインで代行するサービスです。専任担当者がつくため引き継ぎの手間が少なく、経理以外の業務もまとめてお任せできるのが特徴です。税理士への確定申告対応は別途必要ですが、日常業務のアウトソーシングには非常に効果的です。

フジ子さん

本ブログを運営する「フジ子さん」では、税理士事務所での実務経験を積んだオンラインアシスタントが経理業務全般を代行しています。※『オンラインアシスタント』はBPOテクノロジー株式会社の登録商標です。

クライアントの1年以上継続利用率は90%を超え、確かな業務品質と丁寧なサポートが高い評価を得ています。

料金は業界水準の約半額に設定しており、月20時間実働プランでは税込65,560円／月からご利用いただけます（2025年4月1日より新価格）。

経理以外にも総務・人事・秘書、Webデザイン、翻訳など幅広い業務に対応しており、バックオフィス全体を一括でお任せしたい企業に特に向いています。

2時間の無料トライアルも実施していますので、まずは実際の業務感をお試しください。

【フジ子さんのサービス詳細はこちらから】

i-STAFF（アイスタッフ）

出典:i-STAFF

「i-STAFF（アイスタッフ）」は、ファイブスターネット株式会社が運営するオンライン事務代行サービスです。スタッフの採用率はわずか1%という厳格な基準を設けており、多段階の採用プロセスと各専門業務のスキルテストを通過した優秀なスタッフのみが在籍しています。

freeeを活用した経理代行・導入サポートにも対応しており、月額89,100円〜（税込）／月30時間から利用可能。

返金保証制度により、「サービスに満足できなかった」という場合の保証があるため、初めての方でも安心して利用できます。3時間の無料お試しも実施しており、スタッフとの相性を確かめてから本契約を決められます。

【i-STAFFのサービス詳細はこちらから】

CASTER BIZ

出典:CASTER BIZ

「CASTER BIZ」は導入実績6,000社以上を誇る、オンライン秘書の草分け的存在です。採用率1%という厳しい基準をくぐり抜けたスタッフが在籍しており、複雑な経理業務から高度な資料作成まで、高いレベルで対応できる実力派が揃っています。

料金は30時間実働で月額13.2万円〜（税込）。クライアントの状況にあわせてプランをカスタマイズできるため、無駄なコストを省きながら必要な業務だけを依頼できます。業務量の増減に柔軟に対応できるため、事業拡大フェーズにある企業にも好評です。

【CASTER BIZのサービス詳細はこちらから】

freee会計代行に関するよくある質問

経理代行の導入を検討している方からよく寄せられる疑問をQ&A形式でまとめました。契約前に確認しておきたいポイントを網羅していますので、業者選びの参考にしてください。

Q：freeeを使った経理代行は税理士法に違反しませんか？

A：記帳（仕訳入力・帳簿作成）は税理士でなくても行える業務です。ただし、確定申告書の作成・提出代行や税務相談は税理士法に定める業務にあたるため、税理士資格が必要です。経理代行業者に依頼する際は、対応できる業務の範囲を必ず事前に確認しましょう。

Q：freeeを導入していなくても依頼できますか？

A：freee未導入の場合でも、初期設定・導入サポートから対応してくれる業者が多くあります。freeeの契約からアカウント設定・口座連携まで一緒に進めてもらえるため、初めてでも安心です。まずは「freee未導入」だと伝えた上で問い合わせてみてください。

Q：決算対応まで依頼できますか？

A：税理士事務所型のサービスであれば、決算書の作成・法人税申告まで一気通貫で依頼できます。オンライン秘書型は日常の記帳・経理業務が中心で、決算申告には対応していないケースが多いため、別途税理士を手配する必要があります。

Q：途中で依頼する業務範囲を変更できますか？

A：ほとんどの業者で対応可能です。最初は記帳代行のみで始め、慣れてきたら給与計算や請求書対応を追加するというケースはよくあります。契約内容の変更ができるか、その際の料金変更はどうなるかを事前に確認しておきましょう。

Q：freeeの操作が不慣れでも依頼できますか？

A：はい、問題ありません。本記事でご紹介した業者の多くは、freeeの初期設定から操作指導・導入サポートまで対応しています。freeeをまったく使ったことがない状態からでも、スムーズにスタートできます。

Q：会計情報を外部に出すセキュリティは大丈夫ですか？

A：信頼できる業者は、秘密保持契約（NDA）の締結、データの暗号化、アクセス権限の厳格な管理など、適切なセキュリティ対策を講じています。契約前に情報管理ポリシーを確認し、NDAを締結できるかどうかも必ず確認しましょう。

Q：紙の領収書や書類はどのように対応しますか？

A：郵送・スキャンデータの送付・スマートフォンの撮影アプリ連携など、業者によって対応方法が異なります。freeeには領収書の写真→自動読み取り機能があり、撮影したデータを送るだけでOKという業者も増えています。契約前に確認しておくとスムーズに運用できます。

Q：freee会計を使った経理代行に向いていないケースはありますか？

A：freeeの自動連携機能は非常に便利ですが、現金取引が多い業種や複雑な原価管理が必要な製造業などでは、自動化の恩恵が受けにくく手動入力の負担が残るケースがあります。また、業者によっては対応できる仕訳パターンに限りがあるため、特殊な取引が多い場合は事前に確認が必要です。「freeeに対応している」と謳っていても、実際のスキルや実績は業者によって差があるため、導入前に実績を確認することが重要です。

まとめ

本記事では、freee会計に対応したおすすめの経理代行・記帳代行サービスを7社ご紹介しました。自社の状況に合わせた選び方をまとめると次のとおりです。

freeeは単なる入力ツールではなく、自社の経営状況をリアルタイムで正確に把握できる強力なツールです。その力を最大限に引き出すためには、freeeに精通した経理代行業者と組むことがポイントです。

まずは複数社に無料相談してみて、料金・対応範囲・担当者との相性を確認した上で、自社にぴったりの業者を見つけてください。オンラインアシスタント フジ子さんでは、無料トライアルを実施しています。まずは実際の業務感を試してみてください。